鱼缸用过滤泵必须24小时连续开，不能停机，尤其是夜里停机会使鱼缸缺氧。过滤泵设计可以连续运行不间断，如果用的是潜水泵，泵头一定要浸在水里，不能缺水。过滤材料不可勤洗，一周洗一次太勤，不利于细菌的成长可大大减少固体废物的产生，可使过滤效果显著增加。清洗滤材要一分为二，每次洗一半。方法是在换水时将滤材取出脏多的一半，放入从缸里抽出的水里轻轻漂洗，千万不可洗，更不能用自来水洗，否则菌被消灭，导致过滤效能降低。
鱼缸水泵的选择：
1、缸体大小：这个主要是整缸水量，潜水泵的流量（L／H）一般是以每小时将整缸水循环7—10次。
2、滤仓大小：因为滤仓容积越大，可以添加的滤材就越多，滤材展开的过滤面积就会越大，整体过滤面积就会越大；同时意味着大滤仓可以承受更大水流量的经过。
3、鱼只密度：鱼越多，吃的越多，产生的排泄物就会越多，就会需要更大流量来循环清洁水体；同时很多小白鱼友发现粪便抽不动，很多时候是水泵功率小，抽水能力不足所致。
4、鱼儿的大小，有时候也是影响水泵选择的因素之一，水泵工作产生的水流引力对中大型鱼儿影响不大；主要是一些喜欢静水小型鱼儿（≤5CM）和刚孵化的幼苗，因为游动能力差，很容易被水泵的强大水流吸附住，轻则损伤鳃部，重则直接致死，除了以上因素，这些因素也需要考虑。
